Fbx es un formato diseñado como un estándar de intercambio de interoperabilidad para pasar activos entre herramientas. Almacena datos de geometría, material y animación en una forma genérica diseñada para ser transferida.
Blend es un formato patentado para blender. Almacena datos de la misma manera que Blender funciona, por lo que conservará elementos como el historial de edición.
Ambos tienen sus usos.
Si está trabajando en algo en Blender, querrá guardar la copia de trabajo en un archivo de mezcla y mantener un archivo de mezcla como su maestro de arte. El archivo de mezcla obtendrá mejores resultados cuando se cargue en Blender que un archivo fbx exportado de la misma escena.
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Si está transfiriendo su trabajo de Blender a otra herramienta de software, ya sea un motor de juego como Unity o Unreal, o tal vez una herramienta de texturizado como Substance Painter, querrá guardar un archivo fbx. Esto almacenará todo lo que se necesita para la interoperabilidad, pero descartará toda la información específica de la licuadora que el otro programa no podrá usar de todos modos.
Si quiere borrarlo antes, le recomiendo que use ambos formatos de archivo.
Use blend como sus maestros de arte, para trabajar en archivos dentro de blender, y almacénelos en un repositorio de control de fuente para maestros de arte.
Use fbx para su interoperabilidad. Estos son los que deben ir a su proyecto y almacenarse en el repositorio de control de fuente de su juego.
Si no está utilizando el control de fuente, descarte absolutamente todo lo que está haciendo y configure el control de fuente ahora.
Absolutamente nada en lo que esté trabajando es lo suficientemente importante como para que ocurra antes de configurar el control de fuente.