Claire se convirtió en víctima del mismo ‘virus’ que enloqueció a Rousseau. Ella creía que los Otros habían secuestrado a su hijo, Aaron (habían tratado de atraparlo desde antes de que él naciera, al secuestrarla), cuando en realidad Kate lo mantuvo a salvo, lo sacó de la isla y lo hizo pasar por el suyo.
Cuando los “Oceanic Six” regresaron a la Isla (en realidad cinco de ellos, más el cuerpo de Locke y Ben), Claire gradualmente se reveló ante ellos, convirtiéndose en una ‘niña salvaje’, delirante y sucia, y bastante más experta en armamento que ella había estado en el pasado. Ella buscó orientación en el cuerpo de Smoke-Monster-in-Locke, pero finalmente se liberó de él y comenzó a recuperar un poco su cordura. Sin embargo, cuando Kate se ofreció a llevarla a casa y reunirla con Aaron (Kate lo había dejado con la madre de Claire), ella se negó, no queriendo que su hijo la viera en su condición actual, y creyendo que era una madre completamente inadecuada. Kate le aseguró que ayudaría a Claire de cualquier forma necesaria, y se subió al avión. Dado que el avión despegó y que la isla se salvó y el mal evitó abrumar al mundo, supongo que Claire se reunió con éxito con su hijo.
En la sección de la temporada del “más allá”, Claire descubrió que Jack era su medio hermano, y su alma “se abrió” para abarcar sus recuerdos de la isla cuando vio a Charlie con DriveShaft: una vez más le entregó al bebé y su conexión. fue reafirmado por toda la eternidad.