¿Qué es más común en la ciencia ficción: los protagonistas individuales que son más fuertes que un enemigo más numeroso, o los protagonistas más numerosos frente a unos pocos enemigos poderosos?

Cuando hay muchos protagonistas, el alcance dramático tiende a reducirse a unos pocos seleccionados para que el lector / espectador pueda invertir en personajes particulares.
Las películas militares de ciencia ficción se centran en un grupo de soldados, siguiéndolos a través de sus escaramuzas, y mientras hay oleadas de tropas opuestas sin nombre. Incluso en esos casos, lo que se representa sigue siendo el escenario de “pocos protagonistas”.
Y dado que luchar contra esas tropas enemigas no es lo que gana el día, realmente no los llamaría antagonistas. Son solo el guante para llegar a los antagonistas.

Es raro ver algo que sea realmente muchos contra uno, porque ese generalmente tendrá secuaces (y por lo tanto se convertirá en muchos).

Y, de manera similar, en los escenarios de “una persona contra el mundo”, el “mundo” generalmente está representado por unos pocos actores clave, para reducir el alcance dramático. La excepción serían cosas como el género zombie, donde simplemente … siguen … llegando, y no hay antagonista clave o grupo de antagonistas cuya derrota lo detenga.

En general, incluso si hay más personas involucradas en un lado, o en ambos lados, las batallas finales generalmente se reducen a pocas contra pocas, una contra una, o pocas contra una. Entonces diría que esos son los más comunes.