Calibre lo hará bastante bien. El problema es que convertir PDF a cualquier formato de libro electrónico es bastante horrible, por lo que es bastante relativo.
Su salida estará llena de:
- cosas extrañas alrededor de los saltos de página (encabezados y folios que se arrastran)
- errores de separación silábica
- saltos de capítulo y escena desgarrados
- fuentes y estilos desmantelados
- estructura rota (enlaces de tablas de contenido, etc.)
No será un epub particularmente limpio o bien diseñado, es la cosa.
Si alguna vez necesito hacer esto, y lo he hecho, de vez en cuando, utilizo Calibre para convertirlo al formato RTF en Microsoft Word primero, luego uso buscar y reemplazar, y la corrección ortográfica y cosas para arreglarlo hasta que sea bastante razonable y lógico; luego convertir a EPUB desde allí.