¿Qué sistema utilizan los escritores para realizar un seguimiento de los capítulos y reescrituras más pequeñas en el curso de un trabajo largo?

Disculpas por la respuesta tardía.

En términos de software para rastrear las diversas partes de un proyecto de escritura y unirlas, una aplicación llamada Scrivener es bastante popular para este propósito:
Literatura y Latte – Software de escritura Scrivener

Tiene una amplia variedad de herramientas y características, pero lo esencial es que tiene un “proyecto” principal que contiene capítulos / secciones / documentos / lo que sea, carpetas de investigación, un panel de notas de corcho, etc. juntos y formateados en un manuscrito terminado en una variedad de formas.

Si está familiarizado con el desarrollo de software, la analogía más simple es que es un IDE para escritores. A mí también me gusta mucho, por todo lo que solo uso las características básicas.

Algunas revisiones más de esto:
Revisión de Scrivener
Pruebe Scrivener para Windows para proyectos de escritura largos | Mundo PC
Revisión del jueves: más sobre Scrivener, parte 1

Escribo un libro de adelante hacia atrás. Generalmente mantengo todos los capítulos juntos, en orden. Generalmente leo desde el comienzo del capítulo en el que estoy trabajando hasta el punto en que dejé de escribir y hago cambios menores a medida que avanzo. Entonces empiezo a escribir. Si algo cambia y hago cambios importantes en el manuscrito, incluso en un solo capítulo, guardaré lo que tenía y pasaré al siguiente número de versión para la parte que estoy cambiando.